Flavio Bauer é graduado e pós-graduado em Administração de Empresas pela Escola de Administração de Empresas da Fundação Getúlio Vargas. Iniciou sua carreira de seguros em 1978 como estagiário na área financeira da Vera Cruz Seguradora. Depois de formado, estagiou em uma corretora de seguros e resseguros em Londres e em uma seguradora e resseguradora em Aachen na Alemanha.